兒童常見的心臟疾病大概有下列幾種：(1)先天性心臟病(2)風濕性心臟病(3)心肌症(4)心律不整(5)其他相關疾病合併心臟病變等（如川崎氏症），其中仍以先天性心臟病最為常見。先天性心臟病的發生率不論在已發展或發展中的國家皆很相近，占活產的新生兒約千分之八。因此若以我國的出生率，每年約有2,400位新出生的小寶寶可能罹患先天性心臟病，這數目乍看之下實在驚人，還好需要治療的先天性心臟病兒只佔一半左右。先天性心臟病的病因大部分原因不明，只有少數病兒與染色體異常或胎內感染有關。先天性心臟病種類很多，病情差異性也很大，較常見的是分隔心臟左右兩側的中隔有缺損（例如心室中隔缺損、心房中隔缺損），或主動脈與肺動脈之間有不正常的血管相連（開放性動脈導管）。